1.飲用水檢測項目：
（1）感官性質化學指標：色度、渾濁度、臭和味、肉眼可見物、PH、鋁、鐵、錳、銅、鋅、氯化物、硫酸鹽、溶解性總固體、總硬度、耗氧量、揮發酚類、陰離子合成洗滌劑
毒理指標：砷、鎘、鉻、汞、硒氰化物、氟化物、硝酸鹽、三氯甲烷、四氯化碳、溴酸鹽、甲醛、亞氯酸鹽、氯酸鹽
（2）微生物指標：總大腸菌群、耐熱大腸菌群、大腸埃希氏菌、致病菌、菌落總數
（3）放射性指標：總α放射性、總β放射性
2.工業用水檢測項目：
（1）微生物：菌落總數、大腸菌群、霉菌、酵母菌、沙門氏菌、志賀氏菌、大腸埃希氏菌、副溶血性弧菌、金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌、產氣夾膜梭菌、蠟樣芽孢桿菌、單核細胞增生李斯特氏菌、軍團菌、霍亂弧菌、阪崎腸桿菌、空腸彎桿菌、銅綠假單胞菌、腸球菌等
（2）感官性狀：色度、渾濁度、臭和味、肉眼可見物等
（3）物理指標：PH值、電導率、總硬度、溶解性總固體、揮發酚、陰離子合成洗滌劑等
（4）綜合指標：耗氧量、生化需氧量、總有機碳等
（5）金屬元素：鈹、鉛、鎘、鉻、汞、鉈、鉀、鈣、鈉、鎂、磷、鐵、砷、硒、鋅、錫、錳、鈷、鎳、碘、釩等
（6）無機非金屬：硫酸鹽、氯化物、氯酸鹽、亞氯酸鹽、氟化物、硝酸鹽氮、硫化物、磷酸鹽、硼、氨氮、亞硝酸鹽、碘化物、溴酸鹽等
（7）有機物：苯、二甲苯、苯并芘、雙酚A、甲醛、四氯化碳、一氯二溴甲烷、二氯一溴甲烷、三氯乙烯、四氯乙烯、三溴甲烷、鄰苯二甲酸二（2-乙基已基）酯等
3.其他水樣檢測項目：
（1）工業鍋爐水：懸浮物、溶解氧、總硬度、溶解固形物、硫酸根、磷酸根、相對堿度、含鐵量、氯離子含量、含油量、PH值等
（2）工業廢水：電導率、透明度、PH值、全鹽量、總硬度、色度、濁度、懸浮物、酸度、堿度、六價鉻、總汞、銅、鋅、鉛、鎘、鎳、鐵、錳、鈹、總鉻、鉀、鈉、鈣、鎂、總砷、硒、鋇、鉬、鈷、溶解氧、氨氮、亞硝酸鹽氮、硝酸鹽氮、硫酸鹽、總氮、總磷、氟化物、硫化物、高錳酸鹽指數、生化需氧量、化學需氧量、揮發性酚、石油類、動植物油、陰離子表面活性劑、苯、甲苯、乙苯、對二甲苯、鄰二甲苯、間二甲苯、苯乙烯等
（3）農田灌溉水：生化需氧量（BOD5)、化學需氧量（CODcr）、懸浮物、陰離子表面活性劑（LAS)、凱氏氮總磷（以P計）、水溫、PH值、全鹽量、氯化物、硫化物、總汞、總鎘、總砷、鉻（六價）、總鉛、總銅、總鋅、總硒、氟化物、石油類、揮發酚、苯、三氯乙醛、丙烯醛、硼、糞大腸菌群數、蛔蟲卵等